Пользовательские настройки:

• ~/.local/share/applications/mimeapps.list
• ~/.local/share/applications/mimeinfo.cache

Папка /usr/share/applications

Основной файл /usr/share/applications/mimeinfo.cache

Файлы программ /usr/share/applications/*desktop

/usr/share/mime/types

Обновление:

update-mime-database /usr/share/mime

What does Unknown media type in type 'all/all' mean? [duplicate]